Ο εσωτερικός ύφαλος (ή υφαλοπάτωμα) είναι η περιοχή με ελάχιστο βάθος που ξεκινάει από την παραλία και προστατεύεται έτσι από το κύμα. Είναι το ίδιο κομμάτι που ονομάζουμε λιμνοθάλασσα, αλλά δεν είναι κανόνας να έχει κάποια λωρίδα ξηράς για να το διαχωρίζει από την ανοιχτή θάλασσα. Καλύπτεται από άμμο και κοραλλοθρύμματα, λιβάδια φανερόγαμων ή μακροφυκών, μαλακά κοράλλια και τμήματα βυθού με πυκνή κάλυψη από σκληρά κοράλλια. Τα κοράλλια σε αυτή την περιοχή έχουν προσαρμοσθεί ώστε να αντέχουν σε μεγάλες αλλαγές της θερμοκρασίας, φωτός, αλατότητας και διαλυμένου οξυγόνου. Εξαιτίας των δύσκολων αυτών συνθηκών, υπάρχει πολύ περιορισμένη ανάπτυξη κοραλλιών σε αυτές τις περιοχές. Η μεγαλύτερη ανάπτυξη κοραλλιών εμφανίζεται πέρα από αυτή τη ζώνη, όμως υπάρχουν ορισμένα είδη που ζουν και έχουν προσαρμοστεί εδώ, τα οποία δεν θα τα δεις αλλού.