Στη Θεολογική και τη Φιλοσοφική σχολή δίδαξαν γνωστοί Έλληνες λόγιοι όπως ο Ανδρεάς Κάλβος, με καταγωγή από τη Ζάκυνθο, ο οποίος ήταν από τους σημαντικότερους Έλληνες ποιητές. Μάλιστα, στην Ιόνιο Ακαδημία, κατά την περίοδο του γλωσσικού διχασμού, ακούστηκε και διαμορφώθηκε (μέσα από ποικίλες προστριβές και διακυμάνσεις) η ακαδημαϊκή νεοελληνική γλώσσα και εκδόθηκαν τα πρώτα νεοελληνικά πανεπιστημιακά συγγράμματα.