Η Ελληνική Επανάσταση του 1821 μετέτρεψε τον ιερό για τους Οθωμανούς χώρο σε πεδίο μαχών. Σύμφωνα με μαρτυρία του στρατηγού Μακρυγιάννη, φημισμένοι οπλαρχηγοί και οι άντρες τους συγκεντρώθηκαν στο Μαράτι όπου υπήρχαν «περιβόλια κι᾿ ὀλίγα σπίτια κ᾿ ἕνα τζαμὶ πολλὰ δυνατό». Οι Τούρκοι επιτέθηκαν με «πεζούρα και καβαλαρία», σκότωσαν και πλήγωσαν αρκετούς Έλληνες και έτρεψαν τους υπόλοιπους σε φυγή. Όμως στο τζαμί κλείστηκαν ο Γεώργιος Καραϊσκάκης και ο Μάρκος Μπότσαρης, που πολέμησαν γενναία τον εχθρό. Σύντομα επέστρεψαν κι όσοι προηγουμένως είχαν εγκαταλείψει τη μάχη κι όλοι μαζί «κάμαν ἕναν μεγάλον σκοτωμὸν τῶν Τούρκων καὶ τοὺς βάλαν εἰς τὴν Ἄρτα».