Το 1788, ο άρχοντας των Ιωαννίνων, ο Αλή Πασάς, θεμελιώνει το Σεράι του ψηλά, στο Κάστρο, για να αγναντεύει τα νερά της λίμνης. Οι ξένοι περιηγητές θαμπώνονται. Πρόκειται για παλάτι ζηλευτό, με αίθρια, λουτρά, άλογα, υπηρέτες και διαμερίσματα πολυτελή για τον πασά και για την οικογένειά του. Με βυζαντινούς κίονες στολίζει ο Αλής το Σαντέφ Οδάν του, την αίθουσα υποδοχής, και με ανάκλιντρα του οίκου Gobelins, φερμένα από το Παρίσι. Το τέλος του Αλή Πασά, που τόλμησε να αψηφίσει το σουλτάνο, γίνεται τέλος εποχής και για το Σεράι. Το λαμπερό παλάτι γίνεται Διοικητικό Κέντρο. Όταν το 1870 καταστρέφεται από πυρκαγιά, στη θέση του χτίζεται το Στρατιωτικό Νοσοκομείο, κατεδαφίζεται όμως κι αυτό και ανεγείρεται, το 1958, το Βασιλικό Περίπτερο. Εδώ στεγάζεται πλέον το Βυζαντινό Μουσείο.